En 2006, en collaboration avec l’association des Naturalistes Vendéens, le dégagement du couloir d’accès du souterrain du Haut Moyen Age situé sous l’église d’Aubigny, fut réalisé dans l’objectif d’y aménager un refuge contrôlé pour les chiroptères (chauves souris).Une entrée barreaudée y fut apposée afin d’en protéger l’entrée.

A cette occasion, l’un des couloirs reconnu, situé sous l’église, permis d’anticiper l’effondrement du carrelage de la nef par une réparation souterraine. Aucun vestige intéressant l’archéologie médiévale ne fut récolté.